Des théories on peut en échaffauder à la pelle, en veux tu en voilà. Personnellement j'en retiendrais deux.
La première, Itachi a fait ça sur les ordres du Sandaime Hokage, car ce derniers avait d'une façon ou d'une autre que Madara était vivant et qu'il comptait s'approprier des corps d'Uchiwa. cette théorie ci part sur la base que Madara ne prend possession que de corps d'Uchiwa pour être immortel, car (et là on rejoint le chapitre 398) ils ont des chakras similaires, le même type de chakra en gros. Donc certes le mal est moins grave que le remède, mais le sandaime aurait décidé ça en connaissance de cause, Itachi a laissé sasuke ne pouvant se résoudre a tuer son petit frère, et madara aurait piqué le corps d'Obito sur un champ de bataille.
La deuxième théorie, toujours aussi tirée par les cheveux, je le reconnais:
Les uchiwa, étant arrogant par nature, complotaient pour prendre le pouvoir à Konoha, un putsch donc, et itachi aurait choisi le parti de Konoha plutôt que celui de son clan. Là on en revient à la description qu'il fait de son clan (cf kakashi gaiden), à tous ceux qui disent qu'avant leur extermination le clan Uchiwa primait sur le clan Hyuuga..... de même, Sasuke est en vie car itachi ne pouvait se résoudre à le tuer.
Pour le combat shodaime Madara, le shodaime a 3 affinités d'apres ce chapitre. Ca aide, surtout si on y rajoute le controle des bijuus...