Ce n'est pas parce que les héros auront un enfant que celui-ci aura toutes les capacités de ses deux parents.
Prenons par exemple le Naruto/Sakura. Si on fait comme vous le dites, ce rejeton aura une quantité incroyable de chakra (et Kyubi n'y est pour rien, vu qu'il n'est pas scellé dans le petit). En plus de ça, il aurait une assez grande maîtrise de sa puissance.
On aurait donc un super medic-nin capable de se cloner par millier et ainsi soigner toute une armée en très peu de temps.
Mais pour cela, il faudrait qu'il aie la rapidité d'appréhension de son père concernant les technique (tous les records battus en ce qui concerne le mutli-clonage, le rasengan et l'affinité) ainsi que l'application et la concentration de sa mère.
Regardons maintenant l'environnement familial. Des parents très souvent absent (lui ne s'est marié que lorsqu'il a trouvé un travail stable ; Hokage, puisqu'il en rêve, et elle travail à l'hôpital de Konoha, où elle a des horaires impossibles) et très turbulents quand ils sont à la maison (même s'il sont plus posé qu'étant jeunes, ce n'est pas un couple modèle en ce qui concerne la tranquillité des mœurs (disputes ou autre)). Le père est attentionné, mais il forcera son enfant au-delà de ses limites, jusqu'à le faire crever de fatigue. La mère est plus compréhensive (elle est tout de même médecin) mais elle est très irritable, et n'hésitera pas à "bousculer" le gosse pour qu'il apprenne.
Face à ça, l'enfant aura la meilleure stratégie possible ; le repli stratégique. Ainsi, il refusera l'enseignement de ses parents en faisant le plus de bêtises possibles pour les énerver. Il n'apprendra que peu de techniques, jusqu'à en ressentir vraiment l'utilité (amour, haine, vengeance, etc.).
En clair, les enfants n'obtiendront jamais toutes les qualités (et tous les défauts) de leurs parents.
Je pourrais faire tous les couples comme ça, mais y'a pas la place ^^.